La gouvernance de l'IOSD est assurée des membres bénévoles. Elle est basée sur des objectifs d'efficacité et de transparence. Trois organes de gouvernance sont chargés de s'assurer du bon fonctionnement de l'institut :
- Le comité directeur ;
- Le conseil d'administration :
- Le comité scientifique.L'organisation des organes de gouvernance est régie par les statuts de l'IOSD.